Revista Eletrônica do Programa de Bolsas - Edição 1

Bolsista: Bárbara Wanessa Delgado Abrantes
Orientador(a): Haiana Charifker Schindler
Coorientador(a): Lilian Maria Lapa Montenegro
Resumo: JUSTIFICATIVA E RELEVÂNCIA A detecção do M. tuberculosis (MTB) na fase inicial da tuberculose (TB) é de suma importância para o bom prognóstico do paciente. O diagnóstico convencional da TB apresenta várias limitações, como a baixa sensibilidade e necessitando de um longo período de incubação[1] Dispositivos analíticos como os biossensores estão entre os mais promissores novos métodos de diagnóstico, devido a sua capacidade em detectar agentes infecciosos de forma rápida, simples e de baixo custo, em comparação com os exames convencionais[3]. Assim, sua aplicação dispensaria estrutura laboratorial, apresentando elevado potencial point of care, ampliando o acesso ao diagnóstico precoce e favorecendo o tratamento especifico adequado. O presente estudo pretende realizar a triagem clínica e laboratorial dos pacientes da rede de saúde pública que serão incluídos para avaliação da plataforma biossensora no diagnóstico da TB. OBJETIVO GERAL Avaliação clínica-epidemiológica e análise laboratorial da plataforma biossensora para tuberculose no estado de Pernambuco OBJETIVOS ESPECÍFICOS • Descrever e avaliar a frequência dos aspectos clínicos, epidemiológicos e laboratoriais envolvidos na elucidação do diagnóstico de tuberculose; • Avaliar o desempenho da plataforma biossensora para o diagnóstico de casos suspeitos de tuberculose METODOLOGIA Locais do estudo: Laboratório de Imunoepidemiologia do IAM/FIOCRUZ. Serão selecionados pacientes suspeitos de TB provenientes dos hospitais da rede SUS de PE. Aspectos éticas: O estudo é parte integrante do projeto: “Estudo de avaliação e validação clínica-laboratorial de testes diagnósticos rápidos point of care, de fácil uso e acessível em regiões com altos índices de tuberculose no Brasil e Índia.” (CAAE: 54981421.7.0000.5190). Coleta e processamento dos espécimes biológicos: De todos os pacientes serão coletadas amostras de escarro e de urina, para serem usadas na avaliação dos testes. • Extração de DNA: Será utilizado o kit QIAmp DNA mini kit (QIagen) de acordo com instruções do fabricante. • Descontaminação de escarro e urina: Será realizada seguindo o Método de Petroff (NaOH 4%). • Plataforma Biossensora: Será determinada uma sequência de oligonucleotídeo específicas (sondas) para detecção do MTB. Para a detecção da molécula-alvo, a amostra sintética e biológica (DNA extraído dos pacientes), será adicionada sobre o transdutor imobilizado com a sonda e incubada por 30 minutos. Em seguida, este dado será convertido para um valor digital correspondente[3]. Análises Estatísticas: Será construído um banco de dados no programa SPSS 13.3, onde também serão executadas as análises estatísticas, com nível de significância no valor de 5%. 4. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS: 1. BRASIL, Ministério da Saúde, Secretária de vigilância em saúde. Doenças infecciosas e parasitárias: Guia de bolso. 8ª ed. Brasília, 2010. 2. SALIMIYAN RIZI et al. The overview and perspectives of biosensors and Mycobacterium tuberculosis: A systematic review. Journal of Cellular Physiology, v. 236, n. 3, p. 1730-1750, 2021. 3. ELOI, P. et al. Rumo a um diagnóstico point-of-care para detecção específica de Mycobacterium tuberculosis a partir de amostras de escarro. Tuberculose, v. 121, p. 101919, 2020.

Bolsista: JOAO SIMAO SILVA GONCALVES
Orientador(a): JOSE BENTO PEREIRA LIMA
Coorientador(a): CYNARA DE MELO RODOVALHO
Resumo: Instituto Oswaldo Cruz - FIOCRUZ Resumo do Subprojeto - Iniciação em Desenvolvimento Tecnológico e Inovação (PIBITI) Avaliação da Nova Metodologia Laficave para Impregnação de Papéis com Malathion João Simão Silva Gonçalves O controle químico de insetos vetores é uma importante estratégia para interromper a transmissão de patógenos. No entanto, o uso intenso de pesticidas em diversas áreas humanas leva à seleção de populações de insetos resistentes a inseticidas, sendo uma ameaça global ao controle de doenças cujos patógenos são transmitidos por vetores. O uso racional destes compostos é uma das formas de mitigar a disseminação da resistência em populações naturais de insetos, sendo o monitoramento recomendado pela Organização Mundial da Saúde (OMS) para os planos nacionais de combate a insetos vetores. Neste sentido, a realização de ensaios de susceptibilidade é um dos principais pilares do MRI, requerendo infraestrutura laboratorial e equipes capacitadas, bem como insumos produzidos com padrão de qualidade reconhecido e indicado pela OMS, a fim de que os resultados sejam comparados ao longo do tempo e entre diferentes laboratórios. Os ensaios OMS com insetos adultos utilizam papéis impregnados com doses diagnósticas de inseticidas usados em Saúde Pública, além de kits relacionados, atualmente produzidos e comercializados exclusivamente pela Universidade da Malásia. Todavia, este único centro não tem sido suficiente para prover as demandas dos países, fazendo a descentralização dessa produção necessária. A OMS selecionou o LBCVIV (antigo LAFICAVE) como opção para suprir esta necessidade, ao menos, para os países das Américas, em reconhecimento a sua expertise. Após workshop realizado na Malásia, algumas adaptações e modificações do método de impregnação do LBCVIV tornaram-se necessárias e novas avaliações são fundamentais para validação desse método e confirmação de sua eficácia. Sendo assim, a realização dos bioensaios, bem como as análises cromatográficas dos papéis, são importantes para verificação da distribuição do inseticida, prazo de validade e número de vezes que os papéis podem ser usados. Os resultados obtidos vão contribuir para que a OMS aceite e reconheça os papéis produzidos pelo LBCVIV.

Bolsista: MILENA NEVES CARVALHO DE JESUS
Orientador(a): Patricia Sampaio Tavares Veras
Coorientador(a): Helena Mariana Pitangueira Teixeira
Resumo: Os cães infectados por L. infantum apresentam um espectro dinâmico de formas clínicas, que podem variar desde uma infecção subclínica até uma doença grave, podendo ser fatal. A progressão da leishmaniose visceral canina (LVC) depende de diversos fatores, entre eles, o tipo de resposta imune desencadeada após a infecção. O papel que a resposta imune desempenha no contexto da progressão e controle da LVC ainda não está completamente compreendido. Mais precisamente, o envolvimento da resposta imunecelular na patologia da doença não são bem esclarecidos. A MO é um dos tecidos de predileção da L. infantum e as células mielóides são uma das principais células hospedeiras do parasita. No entanto, o papel dessas células no desfecho clínico da LVC ainda é pouco estudado. Em razão da necessidade de esclarecer a importância da MO na patogênese da LVC, o objetivo do presente trabalho é validar vias diferentemente modulas identificadas em células da MO de cães resistentes e cães susceptíveis. Em estudo anterior, ainda não publicado, realizamos o sequenciamento de RNA total de células de MO de cães resistentes e susceptíveis selecionados de uma coorte com duração de 4 anos, realizada em área endêmica para LVC. Também foram incluídos no estudo cães controle não infectados por L. infatum. Em seguida ao sequenciamento, os dados brutos gerados foram mapeados e analisados por bioinformática, onde foram identificados genes diferentemente expressos (DEGs) em células da MO de cães resistentes e cães susceptíveis, quando comparados com células da MO de cães controle. Posteriormente foram feitas análises de enriquecimento de anotação de ontologia gênica e vias relacionadas à migração celular e ao reparo de quebra dupla de DNA foram identificadas como diferentemente modulas nas amostras obtidas de cães resistentes e susceptíveis. No presente estudo, os cães resistentes, os susceptíveis e os controles serão reavaliados e novas amostras biológicas serão coletadas para realização da validação das vias que foram anteriormente identificadas como diferentemente moduladas. As vias relacionadas a migração celular serão validadas por ensaios de migração realizados em placas de transwell e as vias relacionadas ao reparo de quebra dupla de DNA serão validadas por ensaios de cometa neutro. Validar essas vias irá contribuir para o melhor entendimento da patogênese da doença e na identificação de potenciais alvos imunoterapêuticos.

Bolsista: MANUELA ALVES BATISTA
Orientador(a): MARIA DE LOURDES AGUIAR OLIVEIRA
Coorientador(a): Não informado
Resumo: Após a identificação dos primeiros casos em Wuhan, o SARS-COV-2 (SC2) se disseminou globalmente. O cenário epidemiológico varia nos distintos países, segundo a fase epidêmica, emergência de novas variantes virais e medidas de intervenção, demonstrando a necessidade de vigilância contínua, mesmo em cenário de redução de novos casos, baixa taxa de transmissibilidade e alta cobertura vacinal como no Rio de Janeiro(RJ). O virus é eliminado no excremento humano, despejado no esgoto ou ambiente. A epidemiologia baseada em esgoto tem sido usada para o monitoramento de SC2, agregando informações sobre a circulação viral pré/pós-bloqueio e vacinação. Estudos revelam alta taxa de detecção de RNA em diferentes matrizes, como esgoto e rios poluídos. Os últimos podem ser fonte alternativa para vigilância ambiental – estratégia central nos locais onde o sistema de esgotamento sanitário é precário/ausente. Contudo, as informações nesse contexto ainda são escassas. Abordagens que permitam estimar a incidência ou monitorar variantes virais no nível populacional são estratégicas para implementar a capacidade de enfrentamento. Esse projeto propõe monitorar a presença de SC2 em águas superficiais contaminadas; ii) avaliar a carga viral de SC2 por bacia hidrográfica e sua associação com dados epidemiológicos e iii) monitorar a circulação de VOCs, com ênfase em territórios com alta concentração de ASN e saneamento básico precário/ausente. Tais informações são centrais para orientar medidas, fortalecer a vigilância e subsidiar o enfrentamento à pandemia. Trata-se de estudo descritivo longitudinal em amostras de água superficial do RJ, compreendendo 6 pontos da Sub-Bacia do Canal do Cunha (SBCC, n=125), coletadas de agosto/2020 a fevereiro/2022. Pontos adicionais incluíram o Canal do Jardim de Alah (Leblon, n=3) e Rio Guandu (Seropedica, n=4). Adicionalmente, 18 amostras de Manaus foram estudadas. A concentração viral foi realizada por filtração em membrana e os ácidos nucléicos extraídos com o kit AllPrep PowerViral DNA/RNA (Qiagen). O SC2 foi pesquisado por RT-PCR em tempo real (Biomanguinhos) e a determinação de VOCs foi realizada utilizando-se o Conjunto para detecção 4Plex e triagem de VOCs (LVRS/ Biomanguinhos). Na SBCC, o RNA viral foi detectado em 76% das amostras, com variação entre os pontos e semanas epidemiológicas. A concentração viral média foi de 4.0log10gc/ml (0.0-4.8log10gc/ml), com maiores concentrações no Canal do Cunha. No Canal do Jardim de Alah e Guandu, encontramos positividade em 33.3% e 50% (4.1-5.0log10gc/ml). Das 18 amostras de Manaus, apenas 2 apresentaram RNA detectável (30,7 e 17.8gc/ml). Nos bairros da SBCC, a detecção viral em águas residuais foi compatível com o cenario epidemiologico. Na SE47 observamos pico de detecção, precedendo ao pico epidêmico de dezembro/2020. Manguinhos, Engenho de Dentro e Cavalcanti apresentaram comostras com alta carga viral. Na SE8-2021, novo pico de detecção coincidiu com a introdução da VOC Gamma. Contexto semelhante foi observado para a Delta. Após período de redução, em dezembro/2021 ocorreu aumento sigificativo da concentração viral em todos os pontos, sinalizando a explosão de casos em janeiro/2022 associada à Omicron - a maior encontrada no período investigado. De 31 submetidas à identificação de VOCs, 7 apresentaram resultados compatíveis com a sua circulação no RJ. As demais amostras não apresentaram amplificação típica. Os achados preliminares evidenciam que, nas áreas com saneamento precário ou ausente, o monitoramento de SC2 em rios poluídos constitui estratégia viável de vigilância. O aumento da concentração viral em água residual precede o aumento da incidência de casos, reiterando a capacidade de identificação precoce de hotspots para intensificação da vigilância epidemiológica. Finalmente, a circulação de novas variantes parece estar associada ao aumento da carga viral em agua residual, reforçando a relevância da vigilância genômica.

Bolsista: Maria Carolina Costa Prado
Orientador(a): SANDRA DE SOUZA HACON
Coorientador(a): Não informado
Resumo: Título do Subprojeto: Alterações Climáticas e seus Impactos sobre as Doenças Transmitidas por Vetores O projeto tem por objetivo propor indicadores que permitam avaliar a associação entre mudanças climáticas e a incidência de doenças transmitidas por vetores no Brasil no período de 2000 a 2020 e por fim estimar a Carga Global das Doenças. Metodologia a) Oficinas com especialistas: As oficinas têm por objetivo discutir os indicadores socioeconômicos, ambientais e climáticos referentes à Leishmaniose. Essas continuarão a ser realizadas a fim de se obter informações específicas sobre cada bioma. b) Refinamento dos indicadores: O refinamento dos indicadores referentes à Leishmaniose estão em curso. Haverá ainda outras reuniões a fim de finalizar os indicadores já refinados. c) Sistematização de informações: Etapa já inicada que continuará em curso nos próximos meses. As informações incluídas nas planilhas serão as seguintes: dimensão do indicador, indicador temático, descrição curta, detalhamento/justificativa, fonte e relevância por bioma. d) Definição de indicadores: Serão definidos indicadores socioeconômicos, ambientais e climáticos das demais doenças a dos dados extraídos da revisão sistemática. Os indicadores referentes às demais doenças já foram definidos. e) Refinamento e finalização de indicadores: Os indicadores referentes às demais doenças serão estudados e trabalhados segundo a mesma metodologia. f) Inserção dos dados na plataforma AdaptaClima: Os indicadores propostos ao final do projeto serão inseridos na Plataforma AdaptaClima pela equipe do Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE) a partir do envio dos indicadores descritos e normalizados de acordo com a ameaça climática e com as doenças analisadas. g) Elaboração de artigos: A partir da definição dos indicadores de cada doença os artigos serão elaborados e submetidos a periódicos nacionais e/ou internacionais, de acordo com a definição a ser feita com a colaboração com todos os autores.

Bolsista: RUTE CRISTINA MARQUES COSTA
Orientador(a): Felipe Arley Costa Pessoa
Coorientador(a): EMANUELLE DE SOUSA FARIAS
Resumo: Os insetos do gênero Culicoides são diminutos, com 1-3 mm de comprimento. É o gênero mais estudado dentro da família Ceratopogonidae, por serem vetores de patógenos de importância médica e veterinária como vírus Língua Azul em ruminantes domésticos e selvagens, e em humanos, vírus Oropouche e algumas espécies de filárias, também são suspeitos a serem vetores de leishmanias. Existem poucos estudos de Culicoides Latreille na região e nenhum estudo para o município de Urucurituba-AM. Essa falta de estudo pode estar relacionada à falta de investimentos, e por conta da dificuldade de se identificar esses dípteros, devido seu diminuto tamanho. Identificar um inseto que possui importância ecológica, econômica e epidemiológica pode contribuir na solução de problemas entomológicos que possam ocorrer. O foco desse trabalho é conhecer a biodiversidade de Culicoides Latreille no município de Urucurituba, identificando as espécies de Culicoides que ocorre na área de estudo e comparando a riqueza, abundância e diversidade nos seguintes ambientes: florestas, borda de florestas e peridomicílio. O trabalho será realizado no município de Urucurituba no estado do Amazonas, em ambientes florestais e periurbanos nos arredores de Urucurituba, entre os rios Madeira e Tapajós. Para a coleta dos insetos será utilizada armadilhas luminosas tipo CDC. As armadilhas serão instaladas a 1,5m acima do solo e permanecerão por 12h no campo, no período de 18h à 6h. As coletas serão realizadas em transecto horizontal. Alguns morfotipos serão processados individualmente no processo de dissecação para a montagem de lâmina para a análise microscópica e identificação morfológica e identificadas em nível de espécie, através de observações por microscopia óptica, utilizando chaves de identificação, artigos com descrição de espécies. Para avaliar os efeitos dos ambientes na abundância e riqueza dos insetos, serão realizados modelos lineares generalizados mistos (GLMM) com distribuição Poison (para riqueza) e distribuição Gaussiana (para abundância). O estudo visa contribuir com o conhecimento sobre a biodiversidade de Culicoides na área de estudo, verificar se há presença de espécies já apontadas com vetoras de doenças, mostrar diferenças na composição de espécies nos diferentes ambientes e relatar quais espécies estão se adaptando ao peridomicílio.